./configure --prefix=/usr/local --enable-shared --enable-gpl --enable-version3 --enable-nonfree --enable-hardcoded-tables --cc=cc --extra-cflags="-I/path/to/include" --extra-ldflags="-L/path/to/lib" --enable-libx264 --enable-libfaac --enable-libmp3lame --enable-libxvid

git にある最新のffmpegが使いたかったので、extra-cflags, extra-ldflagsに homebrewのpathを追加した